Nel 1640 il P. Provinciale Francesco M. Squarciafico da Genova pose la Croce e la prima pietra dell'edificio. Esplulsi i frati durante la bufera napoleonica del 1810, il convento fu trasformato in caserma. Il 16 ottobre 1814 i religiosi poterono rientrare nel chiostro, ma l'abito non lo rimisero che il 10 giugno dell'anno successivo. Dopo le leggi soppressive del 1866 fu messo all'asta e venne riscattato dal Signor Francesco Monticelli per riconsegnarlo ai Cappuccini. Recentemente nell'area dell'orto vi è stato costruito un grande deposito-magazzino per le necessità del Centro missioni. Attualmente il Convento è custodito da una famiglia di missionari laici, mentre la Messa è officiata nei giorni festivi da un frate.